Témata studentských prací:
Témata studentských prací obvykle vypisujeme velice nekonkrétně a s případnými zájemci vždy zadání upravíme podle aktuálních potřeb a zájmu studenta. V podstatě se lze zabývat jednak metodikou difrakce na biologických materiálech a metodikou zpracování experimentálních dat, nebo se věnovat konkrétnímu tématu (např. studium konkrétního biotechnologického enzymu).
Klikněte pro detailnější popis dané tématiky:
Vyučované předměty:
- Úvod do fyziky pevných látek - Petr Kolenko
- Struktura a funkce biologických makromolekul (11SFBM) - cvičení - Petr Kolenko
- Difrakční metody strukturní biologie - Jan Dohnálek
- Praktikum z makromolekulární krystalografie 1,2 - Tomáš Kovaľ
Výukové aplety a stránky:
Kevin Cowtans Ewald sphere
Phonons visualization
Pro zábavu:
Když je třeba něco udělat: video z ÚFPL.
Doktorské práce
Magisterské práce
2023 - Ing. Jakub Hrubý - Analysis of Exchange of Metals in S1 Nuclease using Anomalous Dispersion.
2021 - Ing. Aleš Kravic - Využití rentgenové difrakční analýzy při studiu oxidačních stavů flavin-dependentních oxidáz.
2018 - Ing. Martin Malý - Strukturní analýza komplexů oxidázy s ligandem.
Výzkumné úkoly
2022 - Bc. Karolína Špeldová - Studium vlivu upřesňování modelu proteinu na identifikaci vazby ligandu.
2022 - Bc. Jakub Hrubý - Studium záměny kovů nukleas metodami anomálního rozptylu.
2020 - Bc. Aleš Kravic - Rentgenová difrakční analýza flanin-dependentních oxidáz.
2017 - Bc. Martin Malý - Řešení struktury komplexu oxidázy s ligandem.
Bakalářské práce
2021 - Jakub Hrubý - Difrakční studie modikace kovového klastru S1 nukleasy.
2021 - Karolína Špeldová - Krystalografické testování ligandů S1-P1 nukleasy.
2019 - Viktorie Navarová - Užití in situ rentgenové difrakce na studie vazby ligandů.
2019 - Aleš Kravic - Parametry krystalizace proteinů, aplikace na mikrokrystaly.
2016 - Martin Malý - Optimalizace parametrů zpracování difrakčních dat oxidázy z Microdochium nivale.
Ocenění studentů
Jakub Hrubý (2022) - 1.místo na konferenci "24th Heart of Europe bio-Crystallography meeting"
Jakub Hrubý (2022) - 2.místo na konferenci "Struktura 2022"
Martin Malý (2020) - 2.místo na konferenci "Struktura 2020"
Martin Malý (2019) - 1.místo na konferenci "Struktura 2019"
Martin Malý (2018) - 2.místo na konferenci "9. Česko-Slovenská studentská vědecká konference ve fyzice"
Martin Malý (2017) - 2.místo na konferenci "Struktura 2017"
Leona Švecová (2017) - 1.místo na konferenci "Struktura 2017"
Týden vědy na FJFI
2023 - 3D atomární struktura bílkoviny za 24 hodin
2019 - 3D atomární struktura bílkovin za 24 hodin
2018 - 3D atomární struktura bílkovin za 24 hodin
2017 - Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
2017 - Od slin ke struktuře
2016 - Synchrotronem k léčivům: modeluj si sám
2016 - 3D atomární struktura bílkovin za 24 hodin